李厚基作战不利，湖南战场又悄无声息，段祺瑞自然非常焦急，徐树铮遂于24日再次由北京赶到汉口督战。但此时曹锟与张怀芝都对湖南失去了兴趣，希望尽早回到自己的老巢，加上徐树铮不断到汉口来指手画脚，使得他们心生不快，对徐树铮的作战计划都不予配合。另外，徐树铮任意调动奉军，将奉军调到湖南战场的最前沿，也让张作霖非常反感。张作霖急忙电召孙烈臣、汲金纯和吴俊升回奉天，同时借口边防吃紧调回已经开到湘东的奉军。
（二）
在南军与北军抗衡的同时，在“非常国会”的内部，西南系军阀与国民党之间的矛盾也终于凸显出来。1918年5月4日，“非常国会”通过军政府组织大纲修正案，决定军政府改行总裁合议制，并选举唐绍仪、唐继尧、陆荣廷、伍廷芳、孙中山、林葆怿、岑春煊为军政府政务总裁，其实就是把原本属于孙中山的权力夺回到地方军阀手中，随后便逼迫孙中山辞去大元帅职务，随即离粤抵沪。孙中山离去以后，岑春煊出任政务会议主席总裁，军政府的领导权则再次落入以桂系和滇系为首的西南系实力派手中。
